MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium luteolum DSM 273 chromosome

Total Repeats: 5504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007512	CAA	2	6	101	106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007512	GCT	2	6	161	166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007512	GAA	2	6	167	172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007512	AAG	3	9	208	216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007512	CAA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007512	A	6	6	265	270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007512	T	6	6	1458	1463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007512	CTG	2	6	1475	1480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007512	ATG	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007512	CGA	2	6	1526	1531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007512	GCT	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007512	CCT	2	6	3032	3037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_007512	AGC	2	6	3046	3051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007512	AAGC	2	8	3071	3078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007512	TTC	2	6	4349	4354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007512	TAC	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007512	CCT	2	6	4393	4398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007512	TCT	3	9	6793	6801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007512	TGC	2	6	6847	6852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007512	AAT	2	6	8790	8795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007512	TTC	2	6	8801	8806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007512	ATT	2	6	8842	8847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007512	CGC	2	6	8859	8864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007512	GCC	2	6	8901	8906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007512	GCG	2	6	8913	8918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007512	GTTA	2	8	8924	8931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007512	AT	3	6	8948	8953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007512	T	6	6	10774	10779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007512	ATTC	2	8	11736	11743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007512	TCA	2	6	11756	11761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007512	TCA	2	6	11764	11769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007512	GCCA	2	8	13107	13114	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007512	GTTTT	2	10	13213	13222	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007512	A	6	6	15244	15249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007512	TAT	2	6	15255	15260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007512	GCTT	2	8	15261	15268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007512	G	6	6	15278	15283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007512	TC	3	6	15946	15951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007512	TCC	2	6	16014	16019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007512	GTCC	2	8	16055	16062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007512	CCG	2	6	16064	16069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007512	G	6	6	16079	16084	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007512	CGG	2	6	16110	16115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007512	GAG	2	6	17910	17915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007512	GGT	2	6	22329	22334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007512	AT	3	6	23846	23851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007512	A	9	9	25206	25214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007512	CTA	2	6	27034	27039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007512	A	6	6	27103	27108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007512	T	7	7	27125	27131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007512	TAA	2	6	27151	27156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007512	A	7	7	27177	27183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007512	T	7	7	27221	27227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007512	GCGG	2	8	27837	27844	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007512	TCCGCA	2	12	27869	27880	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007512	T	7	7	27905	27911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007512	CAAACG	2	12	27922	27933	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007512	T	8	8	29861	29868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007512	TA	3	6	29896	29901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007512	CACAAC	2	12	29940	29951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007512	A	6	6	31753	31758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007512	TCC	2	6	31832	31837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007512	CT	3	6	31858	31863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007512	TTA	2	6	31868	31873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007512	TA	3	6	31872	31877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007512	TA	3	6	31888	31893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007512	ACG	2	6	31899	31904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007512	ATA	2	6	31972	31977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007512	AGC	2	6	33574	33579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007512	CCT	2	6	36481	36486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007512	G	6	6	36502	36507	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007512	T	6	6	36523	36528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007512	GCCGCA	2	12	36591	36602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007512	GCT	3	9	36608	36616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007512	GCT	2	6	36635	36640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007512	GCT	2	6	36642	36647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007512	TGG	2	6	36675	36680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007512	T	6	6	36703	36708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007512	CGG	3	9	36746	36754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007512	CAG	2	6	36776	36781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007512	CTT	2	6	36782	36787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007512	GC	3	6	36856	36861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007512	GCTG	2	8	36878	36885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007512	TCG	2	6	36913	36918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007512	GCT	3	9	36980	36988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007512	CATCGT	2	12	36992	37003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007512	CAT	2	6	37016	37021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007512	TAT	2	6	37102	37107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007512	CGC	2	6	37151	37156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007512	T	6	6	37168	37173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007512	CGG	2	6	37191	37196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007512	CCT	2	6	37242	37247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007512	GCG	2	6	37309	37314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007512	GCC	2	6	37315	37320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007512	CGG	2	6	37374	37379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007512	ATG	2	6	37381	37386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007512	GGTC	2	8	37433	37440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007512	GCC	2	6	37938	37943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007512	A	6	6	37949	37954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007512	T	8	8	37961	37968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007512	GGT	2	6	37969	37974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007512	TAT	2	6	37987	37992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007512	TA	3	6	37997	38002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007512	TA	3	6	38013	38018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007512	TTA	2	6	38020	38025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007512	CCCT	2	8	38046	38053	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_007512	CAA	2	6	38057	38062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007512	GGA	2	6	38082	38087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007512	AAC	2	6	39124	39129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007512	CTCC	2	8	40832	40839	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_007512	CTG	2	6	40857	40862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007512	T	7	7	40865	40871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007512	A	7	7	40884	40890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007512	AG	3	6	40896	40901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007512	A	6	6	40979	40984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007512	TA	3	6	41024	41029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007512	CAAA	2	8	41075	41082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007512	ACA	2	6	41440	41445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007512	AGG	2	6	41485	41490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007512	CAA	2	6	42778	42783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007512	GGC	2	6	42790	42795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007512	CGTCC	2	10	42812	42821	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_007512	G	6	6	42828	42833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007512	CGG	2	6	42857	42862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007512	ACA	2	6	46178	46183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007512	TACCG	2	10	47301	47310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_007512	AG	3	6	50780	50785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007512	CCT	2	6	54928	54933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007512	TCC	2	6	54979	54984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007512	CAT	2	6	54996	55001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007512	GCC	2	6	55008	55013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_007512	TCC	2	6	61632	61637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_007512	AGT	2	6	63752	63757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007512	TGA	2	6	63766	63771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007512	GTGGTT	2	12	65546	65557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007512	GTT	2	6	65561	65566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007512	TCA	2	6	65586	65591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007512	AAG	2	6	65596	65601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007512	GTC	2	6	66610	66615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007512	AACA	2	8	66641	66648	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007512	CCGTTC	2	12	66655	66666	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007512	CTG	2	6	66675	66680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007512	CGA	2	6	66780	66785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007512	C	6	6	66850	66855	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_007512	GAA	2	6	66920	66925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007512	GGA	2	6	66931	66936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007512	TCC	2	6	69084	69089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_007512	TGG	2	6	72609	72614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007512	TTGT	2	8	72739	72746	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007512	TA	3	6	72764	72769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007512	ATT	2	6	72778	72783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007512	AT	3	6	72787	72792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007512	CT	3	6	72795	72800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_007512	GA	3	6	72827	72832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_007512	C	6	6	74122	74127	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
157	NC_007512	G	6	6	75361	75366	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_007512	TA	3	6	75491	75496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_007512	GA	3	6	75514	75519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_007512	AG	3	6	75529	75534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_007512	ATT	2	6	75545	75550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_007512	GCG	2	6	77339	77344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_007512	TGC	2	6	77482	77487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_007512	G	6	6	77513	77518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
172	NC_007512	GT	3	6	77550	77555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_007512	GAT	2	6	77641	77646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_007512	TAT	2	6	86075	86080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_007512	GAATT	2	10	86106	86115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_007512	CGG	2	6	87968	87973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_007512	AAT	2	6	87993	87998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_007512	TTG	3	9	92661	92669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_007512	GAC	2	6	111324	111329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_007512	ACCGT	2	10	111338	111347	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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276	NC_007512	CGG	2	6	111615	111620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_007512	ACT	2	6	111699	111704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_007512	ACC	2	6	111887	111892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
280	NC_007512	CCT	2	6	111975	111980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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286	NC_007512	CGT	2	6	112306	112311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_007512	TAA	2	6	112580	112585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_007512	T	7	7	112602	112608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_007512	GTC	2	6	112818	112823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_007512	A	6	6	128856	128861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_007512	CGC	2	6	128958	128963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_007512	CTGT	2	8	145578	145585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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488	NC_007512	GTCT	2	8	149548	149555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_007512	GCC	3	9	149586	149594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
490	NC_007512	GGC	2	6	149606	149611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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